草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿系統最先见的病症的一种。肾公司中CaOx纳米线过饱和状态基性岩会致使肾小管神经元板材损害和凋亡，因而致使肾结石的行成。短链皮脂酸由肠管内好氧池病菌面团发酵饮食纤维素出现，这样不仅在线条肠管第一道防线中起着目的，可是在系統总体水平上也起着主要目的。之中，丁酸是最多样的短链皮脂酸，兼备抗感染和免疫检测抑制造用目的,本研究方案研究丁酸对CaOx肾结石的目的试述内在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院科室泌尿内科吴忠讲解、周子健博士研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠副教授、周子健医生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网络数据药理学学功能，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

一篇文章名称大全：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 用户公司：华山医疗 研发文本：大鼠、HK-2细胞膜 分组名信息：比组（Con）、建模方法组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱保证枝术：网站药理学学加测

基本思路流量图

探究结论

探究员先是搭配大鼠模式，在生活生物化目标和组识方面的问题学刺绣等探究机制发展丁酸也可以以减少CaOx模式大鼠肾CaOx多晶体的成型和受伤，可以改善CaOx模式大鼠的细菌感染受伤和腐蚀物资的过于抒发。不但，丁酸还可调节草酸促进的HK-2血细胞核受伤、腐蚀应激性和血细胞核凋亡。 为探求丁酸架构和靶dna组网上，研究探讨考生从PubChem提取丁酸和丁酸酯的二维和3D架构（图1A）。在PharmMapper参数库和Uniprot参数库处里后共挑选出116个丁酸靶dna组供进两步具体深入分折。将dna组下拉列表导出来STRING参数库，实行PPI网上具体深入分折。Cytoscape给定了顺序排列的前20的核心靶dna组的简要网上图，其中包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这部分核心dna组与网上中的某个dna组均行为 出特定的关联性，证明这部分dna组会切实发挥出着融合效应。GO和KEGG具体深入分折探求了丁酸核心dna组的关联路径和微生理学用途（图1C）。核心dna组包括与类固醇雄性激素回应、阳极氧化物应激性性回应、渗透性氧细胞膜对类固醇雄性激素刺激影响的发应及其对弱酸性检查是否有机物的发应有关系。以上说明，这部分核心dna组包括参与的了阳极氧化物应激性性和对渗透性氧的微生态学发应步骤，是肾结石造成新机制中至关注重的路径，这阐明丁酸会在肾结石中切实发挥出注重效应。

图1| 丁酸结构类型与靶DNA在线分析一下(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进第一步深入论述丁酸对CaOx肾结石真是切靶DNA，论述师根据GEO参数库对GSE73680中营养健康照表与CaOx肾结石用户的DNA文化差异做好了论述。照表组与CaOx结石用户的可观性文化差异形容DNA（DEGs）检测标为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个DNA发生可观发生改变，但其中3379个（89.4%）DNA形容调整，404个（10.6%）DNA形容变动（图2A）。对DEGs做好聚类分析法分折分折，热图凸显了前10个被选中DEGs的二维逐层聚类分析法分折特色（图2B）。很快，论述师根据GeneCards参数库人为鉴定费了370个可能与CaOx肾结石相应的的DNA，关键因素词排名前20位的預測DNA还有相应的性得分如2C一样。因为寻找丁酸对其进行治疗CaOx肾结石的关键因素靶点，论述师将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应的DNA治理受到新一个Venn图。最后，CYP2C9被判定为丁酸关系CaOx肾结石的潜在的靶点(图2D)。不仅，论述师还做好了丁酸与CYP2C9的分子式联结，CYP2C9的6个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸间接目的，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在运用无线网络药学学预测分析CYP2C9是丁酸不良影响CaOx肾结石的靶什么是基因后，论述相关人员还经过受损肿瘤细胞实验所印证了CYP2C9可缩减草酸诱导型的HK-2受损肿瘤细胞的ROS横向、真菌感染损害和凋亡。

图2| 大多据库协力分享分析CYP2C9是丁酸用途于CaOx肾结石的靶dna

的研究结果显示

本科学试验首选察觉丁酸在身体外和内部均能促使性CaOx肾结石模型工具的防氧化物应激反应状态和宫颈细菌感染危害，然后采用网格临床临床药理学筛分取到丁酸危害CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9，后面采用癌癌细胞科学试验灵魂存在CYP2C9在草酸盐成脂的HK-2癌癌细胞ROS水准、宫颈细菌感染危害和凋亡。许多察觉表述丁酸机会采用促使性CYP2C9来促使性CaOx肾结石的防氧化物应激反应状态，减小宫颈细菌感染危害。相应步骤中拜谱生态学给予了网格临床临床药理学技术水平性提供服务于，不仅拜谱生态学可提升 熟透更加完善的基因组组学、球氨基酸组学、细胞代谢组学等多个学食品及技术水平性提供服务于，欢迎语致電了解和咨询！ 决定性论文文献综述：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.